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科技日报沈阳7月13日电 (记者郝晓明)记者从中国科学院大连化学物理研究所获悉,该所研究员朴海龙团队行使生物信息学和机械学习方式,基于代谢物—卵白质相互作用网络和癌症多组学数据,界说了代谢方面具有显著差异性的肝癌亚型,并展现出差异肝癌亚型在预后、免疫、肿瘤微环境、甲基化调控等方面的生物学特征,为肝癌精准医疗提供了主要线索。相关研究功效克日揭晓在《先进科学》上。

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癌细胞的怪异标志是通过调治能量及营养物质代谢,代谢重编程能够促进细胞快速生长和增殖。其作用不仅体现在代谢通路的转变,还可以通过庞大的代谢物—卵白质相互作用流传到其他细胞或组织的生物学历程中。该研究中,基于代谢物—卵白质相互作用网络和肝癌多组学数据,研究团队综合行使庞大网络和机械学习剖析方式,识别了两种在疾病预后具有显著差异性的肝癌亚型。

研究发现,在代谢方面,预后较差的肝癌亚型主要与代谢环境缺氧、代谢酶的高度甲基化、众多代谢通路的下调及多种脂肪酸的累积亲热相关。同时,众多与机体免疫相关的通路在预后较差的亚型中出现显著上调的趋势。通过考察剖析代谢物—卵白质的相互作用,团队展望,不饱和脂肪酸与多个免疫调控卵白存在潜在影响,不饱和脂肪酸的累积可能是免疫通路上调的缘故原由之一。这些肝癌亚型及其生物学特征在多组自力的肝癌行列上获得验证。

此外,研究职员行使肝癌细胞系,通过转录组学和代谢组学实验也验证了该研究中的盘算剖析效果。

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